Tuesday, March 30, 2010

Het lossy formaat

Een lossy formaat is een bestandsformaat waarbij een bepaalde soort compressie toegepast wordt waarbij een deel van de informatie niet bewaard wordt. Het jpg formaat is bijvoorbeeld een lossy formaat. Tengevolge van de toegepaste compressie kan bepaalde informatie in een jpg dus verloren gaan. Bijvoorbeeld een gradient tussen twee kleuren zal in jpg er vaak wat discontinu uit gaan zien. Of bepaalde delen kunnen een beetje blurry worden.

Wednesday, July 1, 2009

Hondsdagen

In Nederland worden dagen waarop het warmer is dan 30 graden Hondsdagen genoemd. In Belgie ligt de grens op 25 graden. De naam Hondsdagen heeft op zich weinig met honden te maken. Wel kan het vaak onweren bij deze temperaturen: echt hondenweer! Ook werden vroeger de honden vaak gemuilkorfd op Hondsdagen uit vrees voor hondsdolheid.

Een bijkomend interessant weetje is dat het tijdens onweren voedsel sneller bederft. Dit is mogelijk het gevolg van de voorafgaande stijgende temperatuur en vochtigheid, wat bacteriegroei bevordert.

(met dank aan Lien voor de nuttige informatie)

Zwezerik

Zwezerik is een synoniem voor thymus, een orgaan dat onder andere T-lymfocyten produceert en hormonen afscheidt. Het is groot bij kinderen en verschrompelt tijdens de puberteit. Kalfszwezerik wordt als een delicatesse beschouwd hoewel ik uit eerste hand vernam dat een kippenfilet eigenlijk lekkerder is.

Tuesday, April 7, 2009

Poorten

Mijn ene informatica collega zegt tegen de andere: "Het downloaden van mijn torrents wordt tegengehouden door de firewall," waarop de andere antwoordt: "je kan misschien eens via een andere poort proberen."

Ik heb nooit begrepen wat een poort is, waar die zich bevindt en hoe je ze kan openen of sluiten. Wel wist ik dat het iets met internet te maken heeft, en had ik al zaken opgevangen zoals "je webbrowser zit op poort 80". Toch vond ik de poorten niet. Voor mede-lefgozers die eens naar de achterkant van een PC gekeken hebben: daar vind je poort 80 niet. Wel een heleboel poepegaatjes voor allerhande kabels, maar zeker geen 80. En voor internet is er meestal maar 1, soms 2. Voor complete durfzakken die een PC zelfs al eens hebben opengevezen: ook daar is poort 80 niet te vinden.

Met het risico compleet uitgelachen te worden en een hoop eer te verliezen, stelde ik de vraag: "Waar vind ik die poorten?" Het antwoord luidde (na luidkeels gelach):
Er is een onderscheid tussen fysische poorten en logische poorten. Fysische poorten bevinden zich achteraan de PC en hier steek je kabeltjes in (de poepegaatjes dus!). Logische poorten zijn iets abstracter. De reden waarom ik ze nooit vond is dus omdat ze fysisch niet bestaan. Wanneer een pakketje informatie je PC binnenkomt, wordt het via logische poorten doorgestuurd naar het programma dat iets met dit pakketje kan doen. Het geheel is te vergelijken met een appartementsblok: de postbode komt binnen met post door de voordeur (= fysische internetpoort) en dumpt de post in de hal. De concierge checkt alle brieven en steekt ze in de desbetreffende brievenbus (= de logische poorten).
Je webbrowser is dus een bewoner van het appartement en zijn brievenbus heeft als nummer '80'.

Dit gezegd zijnde is hetvolgende vrij logisch: poorten kan je open of toe zetten met je firewall.

Wednesday, March 18, 2009

Euchromatin

[This post is in English because I felt like doing so ...]

While working with some recently sequenced genomic data, and figuring that centromere data is missing in most sequencing efforts, I learned about euchromatin today.

Euchromatin is the lightly packed DNA that is available for transcription. The other parts of our genome (called heterochromatin), which consists of the centromere and telomeres, is densely packed and not easily accessibly for proteins. The centromere sequence is made up of large arrays of DNA repeats, and is hypothesized not to be transcribed and thus functionless. Specific histones ("CEN" proteins) bind to the centromeres and cause a specific folding of the centromeres.

Because centromeres consist of large arrays of DNA repeats, it is not easy to sequence these with current methodologies, so the centromeres result in huge gaps (sometimes over 3 megabases) in sequencing efforts.

Tuesday, March 3, 2009

Pileolus

Het "keppeltje" dat bisschoppen en pausen dragen, is helemaal geen keppel. Een keppel is een joods gebruik om het onderscheid te maken tussen de drager en de hogere wereld die aan God toebehoord.

De juiste benaming van de muts die een bisschop of een paus draagt is een pileolus. De traditie om een pileolus te dragen is begonnen om de tonsuur van een geestelijke warm te houden in koude kerken. De tonsuur van een geestelijke is zijn kaalgeschoren scalp, die werd geschoren als verwerping van mode, en als onderwerping en toewijding aan God.

Wat hebben we vandaag geleerd?

Elke dag leren we -- bioinformatici onder elkaar -- wel wat nieuws bij. We leren heel wat bioinformatica-related dingen bij, maar dikwijls komt er ook allerhande nonsens-kennis bovendrijven. Bij deze een blog voor de wereldwijde verspreiding van onze koetjes- en kalfjesweetjes.